lncRNA與microRNA的靶點(diǎn)驗(yàn)證
lncRNA的作用機(jī)制有很多,以ceRNA(competing endogenous RNA,競(jìng)爭(zhēng)性的內(nèi)源RNA)形式發(fā)揮功能是其中的一種,即lncRNA與靶基因的3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合相同的microRNA,降低microRNA對(duì)靶基因的抑制功能,從而上調(diào)靶基因的表達(dá)量。為了檢測(cè)其效果,我們可以用Western Blot檢測(cè)靶蛋白的表達(dá)水平,也可以用qRT-PCR檢測(cè)靶基因的表達(dá)。但是這兩種方式都無(wú)法確定lncRNA是否通過(guò)ceRNA方式調(diào)控靶基因的表達(dá)。因此,我們可以通過(guò)“microRNA與lncRNA結(jié)合驗(yàn)證”,“microRNA與靶基因結(jié)合驗(yàn)證”和“lncRNA與靶基因3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合microRNA驗(yàn)證”實(shí)驗(yàn),構(gòu)建Sensor reporter并進(jìn)行活性檢測(cè),對(duì)lncRNA,microRNA與靶基因這三者間的作用機(jī)制作出準(zhǔn)確判斷。
服務(wù)優(yōu)勢(shì):
(1)利用專(zhuān)業(yè)軟件進(jìn)行miRNA與lncRNA和靶基因3’UTR區(qū)的結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè);
(2)采用Promega公司特有psiCHECK質(zhì)粒;
(3)所采用的Luciferase雙熒光報(bào)告系統(tǒng),可以獲得寬泛的線(xiàn)性定量范圍與極高的靈敏度;
(4)采用瞬時(shí)轉(zhuǎn)染技術(shù),操作簡(jiǎn)便、快速,周期短,適用于絕大多數(shù)細(xì)胞類(lèi)型。
服務(wù)流程:
一、microRNA與lncRNA結(jié)合驗(yàn)證
(1)直接合成靶lncRNA序列或microRNA在靶lncRNA上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)購(gòu)買(mǎi)microRNA mimics;
(4)將報(bào)告載體與microRNA mimics共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶(hù)原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶lncRNA序列中microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變體作為對(duì)照,進(jìn)一步說(shuō)明問(wèn)題。
二、microRNA與靶基因結(jié)合驗(yàn)證
(1)直接合成靶基因3’UTR序列或microRNA在靶基因3’UTR上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)購(gòu)買(mǎi)microRNA mimics;
(4)將報(bào)告載體與microRNA mimics共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶(hù)原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶基因3’UTR區(qū)microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變體作為對(duì)照,進(jìn)一步說(shuō)明問(wèn)題。
三、lncRNA與靶基因3’UTR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合microRNA驗(yàn)證
(1)直接合成靶基因3’UTR序列或microRNA在靶基因3’UTR上的結(jié)合位點(diǎn)序列;
(2)將上述合成的DNA片段克隆至報(bào)告基因載體psiCHECK質(zhì)粒;
(3)直接合成lncRNA序列,構(gòu)建lncRNA過(guò)表達(dá)質(zhì)粒;
(4)將報(bào)告載體與lncRNA表達(dá)載體共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞;
(5)多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平;
(6)數(shù)據(jù)分析,整理提交客戶(hù)原始數(shù)據(jù)及項(xiàng)目報(bào)告;
注:為了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性,可加入靶基因3’UTR區(qū)microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變型報(bào)告載體及lncRNA序列中microRNA預(yù)測(cè)結(jié)合區(qū)域的突變型表達(dá)載體作為對(duì)照,進(jìn)一步說(shuō)明問(wèn)題。
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